付新悦, 宋欣妮, 刘佳丽, 刘玉键, 石松利, 钮树芳, 常虹, 王朋, 齐君, 白万富
目的: 探讨蒙药扫日劳-4(saorilao-4, SRL-4)对参与肺纤维化(pulmonary fibrosis, PF)大鼠肺组织基因调控网络微小RNAs(microRNA, miRNA)以及核心基因的影响。方法: 将大鼠随机分为4组,包括空白对照组(CON)、模型组(MOD)、阳性药对照组和SRL-4组。除CON外,其他组大鼠都通过气管内缓慢注射博来霉素来建立PF模型。取大鼠肺组织,提取总RNA进行转录组测序,使用差异分析软件edge R筛选各组差异表达的miRNA(differentially expressed miRNA, DEM),使用miRanda对DEM的靶基因(differentially expressed gene, DEG)进行预测,利用GO和KEGG对DEG进行生物功能富集分析,使用Cytoscape构建靶基因调控网络,筛选核心基因。结果: MOD与CON相比,筛选出16个DEM,SRL-4和MOD相比,筛选出10个DEM,调控的靶基因有63 052个。GO分析显示SRL-4和MOD的DEG富集在52个GO条目;KEGG分析显示DEG富集于182个信号通路,其中与嘌呤代谢通路相关的基因数最多。通过构建基因调控网络筛选出6个核心基因,即Spata25、Sultan1a1、Mpv17i、Cryba4、Jakmip3和Fkbp5。结论: 通过构建SRL-4和MOD间10个DEM的miRNA-Target调控网络,筛选出6个枢纽基因,它们被认为是治疗PF基因调控网络核心分子。SRL-4 对PF的改善作用可能与miR-433-3p、novel_202 和 miR-150-3p以及6个核心基因有关。嘌呤嘧啶代谢相关通路信号通路可能是治疗PF 的关键靶点和重要途径。